Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEBLO76041 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms