Protein–RNA interactions for Protein: O43745

CHP2, Calcineurin B homologous protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP2O43745 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHP2O43745 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHP2O43745 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHP2O43745 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHP2O43745 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHP2O43745 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHP2O43745 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHP2O43745 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHP2O43745 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHP2O43745 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHP2O43745 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHP2O43745 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHP2O43745 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHP2O43745 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHP2O43745 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHP2O43745 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHP2O43745 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHP2O43745 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHP2O43745 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHP2O43745 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms