Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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UBXN8O00124 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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UBXN8O00124 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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UBXN8O00124 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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