Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPG1Q9Y678 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COPG1Q9Y678 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms