Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms