Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDC42EP3Q9UKI2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms