Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGFRNQ9P2B2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms