Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC88CQ9P219 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC88CQ9P219 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms