Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.78e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.968e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.158e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.518e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.578e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.618e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.668e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.778e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 PPIP5K2-210ENST00000509597 2799 ntTSL 22.43□□□□□ -2.028e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 PPIP5K2-211ENST00000510672 719 ntTSL 31.59□□□□□ -2.158e-8■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.412e-6■■■■■ 33
DROSHAQ9NRR4 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.318e-7■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 USP34-204ENST00000453133 1409 ntTSL 56.58□□□□□ -1.368e-7■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CTCF-203ENST00000566078 1627 ntTSL 246.41■■■■■ 5.021e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.691e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 COPZ2-209ENST00000612370 528 ntTSL 341.96■■■■■ 4.311e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.231e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 AGFG2-203ENST00000430857 915 ntTSL 540.17■■■■■ 4.023e-9■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.741e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 LMO2-205ENST00000465614 869 ntTSL 537.68■■■■□ 3.621e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 XIAP-203ENST00000422098 390 ntTSL 436.25■■■■□ 3.391e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.221e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.121e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MNT-204ENST00000572892 556 ntTSL 432.03■■■□□ 2.721e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.661e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CUTA-208ENST00000482684 837 ntTSL 1 (best)31.19■■■□□ 2.581e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 AGFG2-205ENST00000477022 1327 ntTSL 1 (best)30.9■■■□□ 2.543e-9■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.531e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MNT-202ENST00000571232 508 ntTSL 430.76■■■□□ 2.511e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 LMO4-204ENST00000495705 565 ntTSL 330.74■■■□□ 2.511e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.511e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 XIAP-207ENST00000468691 764 ntTSL 529.96■■■□□ 2.391e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 LMO2-206ENST00000493667 390 ntTSL 329.84■■■□□ 2.371e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.351e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.241e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.221e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.151e-7■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.911e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CSF1-206ENST00000488198 1009 ntTSL 326.97■■□□□ 1.911e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.891e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 DYNC1LI2-206ENST00000564090 566 ntTSL 426■■□□□ 1.751e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 XIAP-208ENST00000481776 598 ntTSL 525.98■■□□□ 1.751e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.661e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 AC008575.2-203ENST00000512790 1850 ntTSL 225.04■■□□□ 1.61e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.571e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 EVL-223ENST00000557384 883 ntTSL 524.73■■□□□ 1.551e-7■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.531e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 XIAP-211ENST00000497906 495 ntTSL 524.36■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF37A-205ENST00000498773 471 ntTSL 323.85■■□□□ 1.411e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.321e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 EGLN3-208ENST00000551935 575 ntTSL 423.19■■□□□ 1.31e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.283e-9■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MNT-207ENST00000575374 936 ntTSL 322.44■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF37A-204ENST00000479469 1148 ntTSL 521.96■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 SRP19-207ENST00000515755 631 ntTSL 221.18■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CUTA-201ENST00000374484 658 ntTSL 321.1■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 LMO4-203ENST00000489303 952 ntTSL 220.81■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 EVL-210ENST00000554045 1754 ntTSL 519.3■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 EVL-207ENST00000553875 837 ntTSL 219.11■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 AC008575.2-201ENST00000503445 506 ntTSL 318.51■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 RELT-207ENST00000545886 4346 ntTSL 218.36■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 LRP8-211ENST00000496580 507 ntTSL 218.19■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MGST3-201ENST00000367883 706 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CUTA-206ENST00000465956 961 ntTSL 217.8■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MGST3-212ENST00000495447 720 ntTSL 317.53■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 AC008575.2-202ENST00000506997 1643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CUTA-211ENST00000488478 676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CUTA-209ENST00000487637 1378 ntTSL 216.02■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CUTA-205ENST00000462802 1054 ntTSL 1 (best)15.7■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 KLHDC4-205ENST00000446344 4444 ntBASIC15.6■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF37A-206ENST00000638053 4448 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 514.88□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ARPP19-212ENST00000569281 661 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CUTA-213ENST00000494751 731 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ARPP19-203ENST00000561971 799 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 EVL-203ENST00000544450 3704 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CUTA-214ENST00000607266 661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 SRP19-204ENST00000505459 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ARPP19-209ENST00000567669 745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 TBC1D23-208ENST00000486274 4054 ntTSL 513.45□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 CUTA-207ENST00000479249 562 ntTSL 313.39□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ARPP19-213ENST00000569723 550 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 32.9
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