Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms