Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUDS3Q9H7L9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms