Protein–RNA interactions for Protein: Q9H270

VPS11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS11Q9H270 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS11Q9H270 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS11Q9H270 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms