Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR7

DDX24, ATP-dependent RNA helicase DDX24, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX24Q9GZR7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 LTBP3-210ENST00000528516 3935 ntTSL 1 (best)20.64■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 LTBP3-218ENST00000530866 3756 ntTSL 214.71□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.442e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.152e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 MRPL4-211ENST00000592514 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 527.67■■■□□ 2.022e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 MRPL4-209ENST00000591054 777 ntTSL 326.99■■□□□ 1.912e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.432e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.382e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 MRPL4-208ENST00000590702 876 ntTSL 517.37■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 NXF1-217ENST00000533671 589 ntTSL 421.21■□□□□ 0.993e-7■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 NXF1-202ENST00000525576 572 ntTSL 413.85□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 CDS2-202ENST00000450570 945 ntTSL 327.19■■□□□ 1.942e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 CDS2-205ENST00000468817 2706 ntTSL 215.87■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 HDAC10-210ENST00000475965 1239 ntTSL 1 (best)22■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 PLCG1-213ENST00000599785 880 ntTSL 510.22□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 SCARF1-207ENST00000573867 939 ntTSL 233.58■■■□□ 2.973e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.653e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ADSSL1-207ENST00000555486 1012 ntTSL 531.12■■■□□ 2.573e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.113e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.063e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.033e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.033e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.023e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.023e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 23e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.953e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.913e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 GALNT1-206ENST00000591924 542 ntTSL 326.56■■□□□ 1.843e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ENKD1-204ENST00000602531 888 ntTSL 326.5■■□□□ 1.833e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 STK11IP-209ENST00000473899 615 ntTSL 226.47■■□□□ 1.833e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.763e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 TBC1D22A-211ENST00000496139 530 ntTSL 425.52■■□□□ 1.683e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ALKBH6-217ENST00000497999 725 ntTSL 525.46■■□□□ 1.673e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 525.22■■□□□ 1.633e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.613e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 TBC1D22A-208ENST00000441936 590 ntTSL 424.92■■□□□ 1.583e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 RBPJ-216ENST00000509158 555 ntTSL 224.91■■□□□ 1.583e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 SIN3B-211ENST00000601141 1473 ntTSL 224.89■■□□□ 1.583e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 TBC1D22A-210ENST00000486163 513 ntTSL 424.81■■□□□ 1.563e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.563e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 FUK-205ENST00000498702 1319 ntTSL 524.36■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.473e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 EPS8L2-225ENST00000533816 540 ntTSL 523.87■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.393e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ALKBH6-204ENST00000461668 793 ntTSL 523.63■■□□□ 1.373e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 AMBRA1-205ENST00000526606 522 ntTSL 423.39■■□□□ 1.333e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 TRPM4-212ENST00000599459 552 ntTSL 223.22■■□□□ 1.313e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.293e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 SIN3B-203ENST00000594235 923 ntTSL 1 (best)23.05■■□□□ 1.283e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ALKBH6-216ENST00000495116 630 ntTSL 222.97■■□□□ 1.273e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 THOP1-208ENST00000587468 671 ntTSL 222.58■■□□□ 1.213e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 KIFC3-221ENST00000565397 810 ntTSL 322.54■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 GMIP-208ENST00000593186 910 ntTSL 522.44■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 SCARF1-206ENST00000573852 2698 ntTSL 1 (best)22.02■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ABCF3-217ENST00000489719 569 ntTSL 421.61■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 CSK-212ENST00000569321 555 ntTSL 221.54■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 TRPM4-208ENST00000597316 780 ntTSL 321.07■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 MZF1-205ENST00000596039 657 ntTSL 220.81■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 MXD4-202ENST00000510822 561 ntTSL 320.32■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 SIDT2-211ENST00000528397 596 ntTSL 320.16■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ALKBH6-214ENST00000490483 861 ntTSL 520.1■□□□□ 0.813e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ALKBH6-215ENST00000490986 977 ntTSL 1 (best)20.1■□□□□ 0.813e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.813e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.813e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 LYPLA2-210ENST00000495365 842 ntTSL 219.84■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ENGASE-207ENST00000583041 481 ntTSL 219.78■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 TMEM43-202ENST00000432444 908 ntTSL 319.63■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 INPP5B-211ENST00000491406 586 ntTSL 519.42■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 CSK-206ENST00000564216 978 ntTSL 319.33■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 CEP44-209ENST00000514712 605 ntTSL 419.3■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 LLGL2-212ENST00000578719 680 ntTSL 319.27■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 FUT11-203ENST00000465695 2408 ntTSL 219.24■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 PKD1P5-205ENST00000545364 644 ntTSL 219.15■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 ALKBH6-211ENST00000481257 553 ntTSL 518.88■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 34.1
DDX24Q9GZR7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 34.1
Retrieved 100 of 28,409 protein–RNA pairs in 240.9 ms