Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM9Q9C026 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM9Q9C026 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM9Q9C026 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms