Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PLVAPQ9BX97 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms