Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOOQ9BVL4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms