Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KATNB1Q9BVA0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms