Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.689e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.29e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 PPP1R16A-203ENST00000526183 4311 ntTSL 216.03■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 NUP93-208ENST00000563858 797 ntTSL 519.16■□□□□ 0.667e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.257e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 NUP93-220ENST00000569842 2834 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.277e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 NUP93-210ENST00000564887 2875 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 POLE-217ENST00000541627 2105 ntTSL 219.12■□□□□ 0.651e-8■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 RNPEPL1-208ENST00000486058 3126 ntTSL 216.24■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.26e-10■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.996e-10■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.786e-10■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.086e-10■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 NGLY1-214ENST00000493324 3058 ntTSL 212.73□□□□□ -0.376e-10■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 NGLY1-203ENST00000308710 2086 ntTSL 1 (best)9.57□□□□□ -0.886e-10■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 NGLY1-201ENST00000280699 1897 ntTSL 57.86□□□□□ -1.156e-10■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.018e-8■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.18e-8■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 PCGF1-207ENST00000496911 837 ntTSL 221.02■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 PCGF1-204ENST00000475863 1056 ntTSL 1 (best)15.17■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 ZZEF1-204ENST00000572426 3226 ntTSL 210.86□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 PCGF1-205ENST00000480844 718 ntTSL 58.93□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 PCGF1-203ENST00000465993 587 ntTSL 37.42□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.455e-6■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.135e-6■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 FUK-203ENST00000464499 4439 ntTSL 214.71□□□□□ -0.065e-6■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 HSPG2-212ENST00000493940 584 ntTSL 514.61□□□□□ -0.078e-8■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 RRM2-204ENST00000461327 580 ntTSL 219.15■□□□□ 0.661e-20■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 RRM2-209ENST00000491447 644 ntTSL 218.22■□□□□ 0.511e-20■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 RRM2-203ENST00000459969 787 ntTSL 213.81□□□□□ -0.21e-20■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 RRM2-210ENST00000498343 560 ntTSL 213.65□□□□□ -0.221e-20■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.732e-8■■■■■ 29.9
BUD13Q9BRD0 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 29.8
BUD13Q9BRD0 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 29.8
BUD13Q9BRD0 DMPK-209ENST00000596067 498 ntTSL 521.42■■□□□ 1.022e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 DMPK-213ENST00000598180 1626 ntTSL 218.23■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 DUS3L-214ENST00000592673 701 ntTSL 214.89□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 LTBR-205ENST00000535739 928 ntTSL 524.28■■□□□ 1.483e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 RPS19BP1-203ENST00000459956 852 ntTSL 223.31■■□□□ 1.323e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.13e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 RPS19BP1-202ENST00000420879 861 ntTSL 221.45■■□□□ 1.023e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 LTBR-206ENST00000536876 842 ntTSL 521.08■□□□□ 0.973e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.763e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 WDR24-203ENST00000567014 757 ntTSL 518.59■□□□□ 0.573e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.523e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.433e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TBC1D17-203ENST00000594984 1441 ntTSL 517.67■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 RPS19BP1-206ENST00000491966 647 ntTSL 217.61■□□□□ 0.413e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TBC1D17-207ENST00000599049 1742 ntTSL 517.25■□□□□ 0.353e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 SLC12A7-204ENST00000513223 1066 ntTSL 517.22■□□□□ 0.353e-10■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.353e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.23e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 29.7
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BUD13Q9BRD0 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.013e-8■■■■■ 29.7
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BUD13Q9BRD0 LTBR-214ENST00000545445 379 ntTSL 213.6□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TBC1D17-205ENST00000596243 2831 ntTSL 1 (best)13.52□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PCBP2-217ENST00000550520 753 ntTSL 312.33□□□□□ -0.442e-17■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 SLC40A1-204ENST00000427419 299 ntTSL 1 (best)11.56□□□□□ -0.563e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 SLC40A1-205ENST00000440626 209 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PCBP2-216ENST00000550192 734 ntTSL 49.67□□□□□ -0.862e-17■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PCBP2-221ENST00000551104 681 ntTSL 39.63□□□□□ -0.872e-17■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 CWC15-206ENST00000621358 1113 ntTSL 59.18□□□□□ -0.943e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 CWC15-201ENST00000279839 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PCBP2-220ENST00000550910 449 ntTSL 36.91□□□□□ -1.32e-17■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 CWC15-205ENST00000616442 559 ntTSL 24.45□□□□□ -1.79e-10■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PLSCR3-206ENST00000573070 1740 ntTSL 529.47■■■□□ 2.313e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.043e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.043e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 23e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 NAGPA-209ENST00000564922 573 ntTSL 425.05■■□□□ 1.63e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.593e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 MKNK1-217ENST00000524749 786 ntTSL 524.92■■□□□ 1.583e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 GLI4-204ENST00000517530 563 ntTSL 224.89■■□□□ 1.583e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.573e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 MKNK1-209ENST00000470237 562 ntTSL 324.65■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 MKNK1-228ENST00000532897 795 ntTSL 224.65■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.55e-7■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 GLI4-209ENST00000522479 435 ntTSL 323.84■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 AVL9-207ENST00000485228 489 ntTSL 523.65■■□□□ 1.383e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PLSCR3-207ENST00000573213 581 ntTSL 323.57■■□□□ 1.363e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMEM256-PLSCR3-203ENST00000571125 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.49■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.153e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.153e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PLSCR3-205ENST00000571802 583 ntTSL 322.12■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.9■■□□□ 1.13e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PLSCR3-208ENST00000573774 2056 ntTSL 221.43■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 29.7
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