RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524749.5

MKNK1-217, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene MKNK1, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1-217ENST00000524749 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.87■■■■■ 6.21
MKNK1-217ENST00000524749 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.52■■■■■ 5.2
MKNK1-217ENST00000524749 ABCC9O60706 1549 aa45.88■■■■■ 4.94
MKNK1-217ENST00000524749 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
MKNK1-217ENST00000524749 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.87■■■■■ 4.77
MKNK1-217ENST00000524749 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.61■■■■■ 4.73
MKNK1-217ENST00000524749 NACADO15069 1562 aa44.59■■■■■ 4.73
MKNK1-217ENST00000524749 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.56■■■■■ 4.72
MKNK1-217ENST00000524749 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.46■■■■■ 4.71
MKNK1-217ENST00000524749 SCRIBQ14160 1630 aa43.42■■■■■ 4.54
MKNK1-217ENST00000524749 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.29■■■■■ 4.52
MKNK1-217ENST00000524749 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.06■■■■■ 4.48
MKNK1-217ENST00000524749 BICRAQ9NZM4 1560 aa43■■■■■ 4.47
MKNK1-217ENST00000524749 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43■■■■■ 4.47
MKNK1-217ENST00000524749 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.86■■■■■ 4.29
MKNK1-217ENST00000524749 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
MKNK1-217ENST00000524749 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
MKNK1-217ENST00000524749 SMARCA4P51532 1647 aa41.6■■■■■ 4.25
MKNK1-217ENST00000524749 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.5■■■■■ 4.23
MKNK1-217ENST00000524749 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.5■■■■■ 4.23
MKNK1-217ENST00000524749 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.5■■■■■ 4.23
MKNK1-217ENST00000524749 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
MKNK1-217ENST00000524749 SMARCA2P51531 1590 aa41.25■■■■■ 4.19
MKNK1-217ENST00000524749 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.25■■■■■ 4.19
MKNK1-217ENST00000524749 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.2■■■■■ 4.19
MKNK1-217ENST00000524749 NCAPD3P42695 1498 aa41.16■■■■■ 4.18
MKNK1-217ENST00000524749 WIZO95785 1651 aa41.05■■■■■ 4.16
MKNK1-217ENST00000524749 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
MKNK1-217ENST00000524749 HMGXB3Q12766 1538 aa40.96■■■■■ 4.15
MKNK1-217ENST00000524749 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
MKNK1-217ENST00000524749 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
MKNK1-217ENST00000524749 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.26■■■■■ 4.03
MKNK1-217ENST00000524749 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.02■■■■■ 4
MKNK1-217ENST00000524749 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.92■■■■□ 3.98
MKNK1-217ENST00000524749 CFTRP13569 1480 aa39.89■■■■□ 3.98
MKNK1-217ENST00000524749 NESP48681 1621 aa39.88■■■■□ 3.97
MKNK1-217ENST00000524749 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.72■■■■□ 3.95
MKNK1-217ENST00000524749 ERCC6Q03468 1493 aa39.55■■■■□ 3.92
MKNK1-217ENST00000524749 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.52■■■■□ 3.92
MKNK1-217ENST00000524749 PRDM2Q13029 1718 aa39.51■■■■□ 3.91
MKNK1-217ENST00000524749 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.4■■■■□ 3.9
MKNK1-217ENST00000524749 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.36■■■■□ 3.89
MKNK1-217ENST00000524749 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.2■■■■□ 3.87
MKNK1-217ENST00000524749 ABCC8Q09428 1581 aa39.07■■■■□ 3.84
MKNK1-217ENST00000524749 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
MKNK1-217ENST00000524749 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
MKNK1-217ENST00000524749 WDR62O43379 1518 aa39■■■■□ 3.83
MKNK1-217ENST00000524749 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.97■■■■□ 3.83
MKNK1-217ENST00000524749 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.95■■■■□ 3.83
MKNK1-217ENST00000524749 TOPBP1Q92547 1522 aa38.94■■■■□ 3.82
MKNK1-217ENST00000524749 CUX1P39880 1505 aa38.89■■■■□ 3.82
MKNK1-217ENST00000524749 CUX2O14529 1486 aa38.86■■■■□ 3.81
MKNK1-217ENST00000524749 TOP2BQ02880 1626 aa38.75■■■■□ 3.79
MKNK1-217ENST00000524749 SYNJ1O43426 1573 aa38.74■■■■□ 3.79
MKNK1-217ENST00000524749 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.7■■■■□ 3.79
MKNK1-217ENST00000524749 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.66■■■■□ 3.78
MKNK1-217ENST00000524749 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
MKNK1-217ENST00000524749 TRIM41Q8WV44 630 aa38.63■■■■□ 3.77
MKNK1-217ENST00000524749 SOGA1O94964 1423 aa38.59■■■■□ 3.77
MKNK1-217ENST00000524749 IFT140Q96RY7 1462 aa38.57■■■■□ 3.76
MKNK1-217ENST00000524749 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.56■■■■□ 3.76
MKNK1-217ENST00000524749 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.48■■■■□ 3.75
MKNK1-217ENST00000524749 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
MKNK1-217ENST00000524749 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.34■■■■□ 3.73
MKNK1-217ENST00000524749 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.27■■■■□ 3.72
MKNK1-217ENST00000524749 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
MKNK1-217ENST00000524749 WDR97A6NE52 1622 aa38.2■■■■□ 3.71
MKNK1-217ENST00000524749 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.2■■■■□ 3.711e-8■■■■■ 42.9
MKNK1-217ENST00000524749 KIF27Q86VH2 1401 aa38.13■■■■□ 3.7
MKNK1-217ENST00000524749 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.12■■■■□ 3.69
MKNK1-217ENST00000524749 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
MKNK1-217ENST00000524749 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.06■■■■□ 3.68
MKNK1-217ENST00000524749 GRIN2BQ13224 1484 aa38.03■■■■□ 3.68
MKNK1-217ENST00000524749 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.91■■■■□ 3.66
MKNK1-217ENST00000524749 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.9■■■■□ 3.66
MKNK1-217ENST00000524749 IGF1RP08069 1367 aa37.89■■■■□ 3.66
MKNK1-217ENST00000524749 EEA1Q15075 1411 aa37.88■■■■□ 3.66
MKNK1-217ENST00000524749 PBRM1Q86U86 1689 aa37.87■■■■□ 3.65
MKNK1-217ENST00000524749 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
MKNK1-217ENST00000524749 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.83■■■■□ 3.65
MKNK1-217ENST00000524749 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
MKNK1-217ENST00000524749 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.77■■■■□ 3.64
MKNK1-217ENST00000524749 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.73■■■■□ 3.63
MKNK1-217ENST00000524749 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
MKNK1-217ENST00000524749 FBLN2P98095 1184 aa37.7■■■■□ 3.63
MKNK1-217ENST00000524749 SYNJ2O15056 1496 aa37.69■■■■□ 3.62
MKNK1-217ENST00000524749 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.68■■■■□ 3.62
MKNK1-217ENST00000524749 CUL7Q14999 1698 aa37.66■■■■□ 3.62
MKNK1-217ENST00000524749 ADAMTS12P58397 1594 aa37.65■■■■□ 3.62
MKNK1-217ENST00000524749 PRXQ9BXM0 1461 aa37.52■■■■□ 3.6
MKNK1-217ENST00000524749 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.52■■■■□ 3.6
MKNK1-217ENST00000524749 GRIN2AQ12879 1464 aa37.51■■■■□ 3.59
MKNK1-217ENST00000524749 OSCARQ8IYS5 282 aa37.5■■■■□ 3.59
MKNK1-217ENST00000524749 CHD1O14646 1710 aa37.47■■■■□ 3.59
MKNK1-217ENST00000524749 KIF21BO75037 1637 aa37.33■■■■□ 3.57
MKNK1-217ENST00000524749 NUP160Q12769 1436 aa37.31■■■■□ 3.56
MKNK1-217ENST00000524749 CEP170Q5SW79 1584 aa37.24■■■■□ 3.55
MKNK1-217ENST00000524749 GOLGA3Q08378 1498 aa37.22■■■■□ 3.55
MKNK1-217ENST00000524749 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.2■■■■□ 3.55
MKNK1-217ENST00000524749 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.9 ms