RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535739.5

LTBR-205, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 5

Gene LTBR, Length 928 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-205ENST00000535739 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.59■■■■■ 5.85
LTBR-205ENST00000535739 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.27■■■■■ 5
LTBR-205ENST00000535739 ABCC9O60706 1549 aa46.26■■■■■ 5
LTBR-205ENST00000535739 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.01■■■■■ 4.64
LTBR-205ENST00000535739 NACADO15069 1562 aa43.71■■■■■ 4.59
LTBR-205ENST00000535739 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.58■■■■■ 4.57
LTBR-205ENST00000535739 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.37■■■■■ 4.53
LTBR-205ENST00000535739 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.11■■■■■ 4.49
LTBR-205ENST00000535739 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.1■■■■■ 4.49
LTBR-205ENST00000535739 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.09■■■■■ 4.49
LTBR-205ENST00000535739 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.77■■■■■ 4.44
LTBR-205ENST00000535739 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
LTBR-205ENST00000535739 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.58■■■■■ 4.41
LTBR-205ENST00000535739 SCRIBQ14160 1630 aa42.2■■■■■ 4.35
LTBR-205ENST00000535739 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.1■■■■■ 4.33
LTBR-205ENST00000535739 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.79■■■■■ 4.28
LTBR-205ENST00000535739 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
LTBR-205ENST00000535739 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.64■■■■■ 4.26
LTBR-205ENST00000535739 NCAPD3P42695 1498 aa40.36■■■■■ 4.05
LTBR-205ENST00000535739 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.26■■■■■ 4.04
LTBR-205ENST00000535739 SMARCA4P51532 1647 aa40.25■■■■■ 4.03
LTBR-205ENST00000535739 SMARCA2P51531 1590 aa40.14■■■■■ 4.02
LTBR-205ENST00000535739 HMGXB3Q12766 1538 aa40.06■■■■■ 4
LTBR-205ENST00000535739 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
LTBR-205ENST00000535739 ERCC6Q03468 1493 aa39.91■■■■□ 3.98
LTBR-205ENST00000535739 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
LTBR-205ENST00000535739 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.83■■■■□ 3.97
LTBR-205ENST00000535739 CUX2O14529 1486 aa39.8■■■■□ 3.96
LTBR-205ENST00000535739 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.78■■■■□ 3.96
LTBR-205ENST00000535739 NESP48681 1621 aa39.76■■■■□ 3.96
LTBR-205ENST00000535739 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.74■■■■□ 3.95
LTBR-205ENST00000535739 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.45■■■■□ 3.91
LTBR-205ENST00000535739 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
LTBR-205ENST00000535739 WIZO95785 1651 aa39.33■■■■□ 3.89
LTBR-205ENST00000535739 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.27■■■■□ 3.88
LTBR-205ENST00000535739 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.21■■■■□ 3.87
LTBR-205ENST00000535739 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.14■■■■□ 3.86
LTBR-205ENST00000535739 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
LTBR-205ENST00000535739 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.88■■■■□ 3.81
LTBR-205ENST00000535739 WDR62O43379 1518 aa38.79■■■■□ 3.8
LTBR-205ENST00000535739 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
LTBR-205ENST00000535739 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.74■■■■□ 3.79
LTBR-205ENST00000535739 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.72■■■■□ 3.79
LTBR-205ENST00000535739 CFTRP13569 1480 aa38.71■■■■□ 3.79
LTBR-205ENST00000535739 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
LTBR-205ENST00000535739 PRDM2Q13029 1718 aa38.38■■■■□ 3.74
LTBR-205ENST00000535739 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.37■■■■□ 3.73
LTBR-205ENST00000535739 TRIM41Q8WV44 630 aa38.06■■■■□ 3.68
LTBR-205ENST00000535739 OSCARQ8IYS5 282 aa38.01■■■■□ 3.68
LTBR-205ENST00000535739 TOPBP1Q92547 1522 aa37.99■■■■□ 3.67
LTBR-205ENST00000535739 IFT140Q96RY7 1462 aa37.96■■■■□ 3.67
LTBR-205ENST00000535739 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
LTBR-205ENST00000535739 ABCC8Q09428 1581 aa37.87■■■■□ 3.65
LTBR-205ENST00000535739 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.85■■■■□ 3.65
LTBR-205ENST00000535739 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
LTBR-205ENST00000535739 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
LTBR-205ENST00000535739 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
LTBR-205ENST00000535739 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.59■■■■□ 3.613e-7■■■■□ 24.9
LTBR-205ENST00000535739 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.54■■■■□ 3.6
LTBR-205ENST00000535739 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.54■■■■□ 3.6
LTBR-205ENST00000535739 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.54■■■■□ 3.6
LTBR-205ENST00000535739 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.49■■■■□ 3.59
LTBR-205ENST00000535739 CHD1O14646 1710 aa37.47■■■■□ 3.59
LTBR-205ENST00000535739 SOGA1O94964 1423 aa37.44■■■■□ 3.58
LTBR-205ENST00000535739 ARHGEF11O15085 1522 aa37.41■■■■□ 3.58
LTBR-205ENST00000535739 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.39■■■■□ 3.58
LTBR-205ENST00000535739 CUX1P39880 1505 aa37.37■■■■□ 3.57
LTBR-205ENST00000535739 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
LTBR-205ENST00000535739 FBLN2P98095 1184 aa37.34■■■■□ 3.57
LTBR-205ENST00000535739 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.56
LTBR-205ENST00000535739 WDR97A6NE52 1622 aa37.23■■■■□ 3.55
LTBR-205ENST00000535739 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.2■■■■□ 3.54
LTBR-205ENST00000535739 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.15■■■■□ 3.54
LTBR-205ENST00000535739 GRIN2BQ13224 1484 aa37.09■■■■□ 3.53
LTBR-205ENST00000535739 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.53
LTBR-205ENST00000535739 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
LTBR-205ENST00000535739 ARAP1Q96P48 1450 aa37.05■■■■□ 3.52
LTBR-205ENST00000535739 PBRM1Q86U86 1689 aa37■■■■□ 3.51
LTBR-205ENST00000535739 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.99■■■■□ 3.51
LTBR-205ENST00000535739 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.98■■■■□ 3.51
LTBR-205ENST00000535739 SYNJ1O43426 1573 aa36.96■■■■□ 3.51
LTBR-205ENST00000535739 SYNJ2O15056 1496 aa36.96■■■■□ 3.51
LTBR-205ENST00000535739 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.95■■■■□ 3.5
LTBR-205ENST00000535739 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.9■■■■□ 3.5
LTBR-205ENST00000535739 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.8■■■■□ 3.48
LTBR-205ENST00000535739 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.78■■■■□ 3.48
LTBR-205ENST00000535739 TOP2BQ02880 1626 aa36.77■■■■□ 3.48
LTBR-205ENST00000535739 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
LTBR-205ENST00000535739 GRIN2AQ12879 1464 aa36.62■■■■□ 3.45
LTBR-205ENST00000535739 ADAMTS12P58397 1594 aa36.61■■■■□ 3.45
LTBR-205ENST00000535739 CEP170Q5SW79 1584 aa36.51■■■■□ 3.44
LTBR-205ENST00000535739 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.5■■■■□ 3.43
LTBR-205ENST00000535739 NUP160Q12769 1436 aa36.49■■■■□ 3.43
LTBR-205ENST00000535739 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.48■■■■□ 3.43
LTBR-205ENST00000535739 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.46■■■■□ 3.43
LTBR-205ENST00000535739 SHROOM2Q13796 1616 aa36.34■■■■□ 3.41
LTBR-205ENST00000535739 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
LTBR-205ENST00000535739 JPH4Q96JJ6 628 aa36.14■■■■□ 3.38
LTBR-205ENST00000535739 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.1■■■■□ 3.37
LTBR-205ENST00000535739 IGF1RP08069 1367 aa36.04■■■■□ 3.36
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