Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOPXQ9BPY8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.8 ms