Protein–RNA interactions for Protein: Q96K30

RITA1, RBPJ-interacting and tubulin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RITA1Q96K30 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RITA1Q96K30 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RITA1Q96K30 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RITA1Q96K30 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms