Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms