Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NLRC3Q7RTR2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NLRC3Q7RTR2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NLRC3Q7RTR2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NLRC3Q7RTR2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NLRC3Q7RTR2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 388.7 ms