Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT2Q7L5N7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT2Q7L5N7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms