Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC55Q6ZSA7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC55Q6ZSA7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms