Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO3Q6UWJ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms