Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNDC11Q6PKC3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC11Q6PKC3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms