Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1L6

ZNF343, Zinc finger protein 343, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF343Q6P1L6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF343Q6P1L6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms