Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF3Q5VWG9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms