Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACHD1Q5VU97 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACHD1Q5VU97 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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