Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPROQ16827 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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