Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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SGCAQ16586 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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SGCAQ16586 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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SGCAQ16586 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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SGCAQ16586 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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SGCAQ16586 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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SGCAQ16586 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCAQ16586 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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