Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD1Q15797 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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