Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NEUROD1Q13562 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NEUROD1Q13562 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms