Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMS2P3Q13401 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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