Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.158e-8■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 PKP4-204ENST00000421462 3099 ntTSL 215.88■□□□□ 0.135e-8■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 PKP4-206ENST00000452162 2359 ntTSL 1 (best)9.99□□□□□ -0.815e-8■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 512.71□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-222ENST00000630907 889 ntTSL 525.17■■□□□ 1.623e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-213ENST00000626793 733 ntTSL 523.52■■□□□ 1.363e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-218ENST00000629252 1112 ntTSL 521.02■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-215ENST00000628267 779 ntTSL 520.78■□□□□ 0.923e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.353e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-219ENST00000629886 436 ntTSL 35.23□□□□□ -1.573e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.613e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.813e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 UBE3A-216ENST00000628733 706 ntTSL 53.55□□□□□ -1.843e-7■■■■■ 32.9
TARDBPQ13148 GS1-600G8.3-201ENST00000431486 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -18e-9■■■■■ 32.8
TARDBPQ13148 ADARB1-206ENST00000449478 704 ntTSL 515.78■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 32.8
TARDBPQ13148 ADARB1-209ENST00000464215 389 ntTSL 37.27□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 32.8
TARDBPQ13148 DNAJC6-207ENST00000494710 1621 ntTSL 524.37■■□□□ 1.498e-8■■■■■ 32.8
TARDBPQ13148 DNAJC6-204ENST00000463018 546 ntTSL 35.65□□□□□ -1.58e-8■■■■■ 32.8
TARDBPQ13148 GRB10-211ENST00000428711 484 ntTSL 210.09□□□□□ -0.797e-9■■■■■ 32.8
TARDBPQ13148 IGF2BP1-206ENST00000515586 768 ntTSL 314.55□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 32.8
TARDBPQ13148 PDXK-206ENST00000398085 796 ntTSL 321.99■■□□□ 1.118e-7■■■■■ 32.8
TARDBPQ13148 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 32.8
TARDBPQ13148 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.488e-7■■■■■ 32.8
TARDBPQ13148 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 32.8
TARDBPQ13148 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 32.8
TARDBPQ13148 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.52e-10■■■■■ 32.7
TARDBPQ13148 PSMG4-208ENST00000454610 2323 ntTSL 214.05□□□□□ -0.162e-10■■■■■ 32.7
TARDBPQ13148 ACAP2-208ENST00000471593 758 ntTSL 39.54□□□□□ -0.882e-10■■■■■ 32.7
TARDBPQ13148 ACAP2-204ENST00000439758 766 ntTSL 45.36□□□□□ -1.552e-10■■■■■ 32.7
TARDBPQ13148 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 32.7
TARDBPQ13148 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 32.7
TARDBPQ13148 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 32.7
TARDBPQ13148 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.636e-7■■■■■ 32.7
TARDBPQ13148 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.38e-7■■■■■ 32.7
TARDBPQ13148 CHST11-204ENST00000549016 573 ntTSL 410.93□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 32.6
TARDBPQ13148 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.127e-7■■■■■ 32.6
TARDBPQ13148 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 07e-8■■■■■ 32.6
TARDBPQ13148 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -07e-8■■■■■ 32.6
TARDBPQ13148 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.057e-8■■■■■ 32.6
TARDBPQ13148 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 32.6
TARDBPQ13148 LARS-210ENST00000508667 707 ntTSL 38.36□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 32.6
TARDBPQ13148 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 32.6
TARDBPQ13148 LARS-209ENST00000507095 384 ntTSL 35.64□□□□□ -1.511e-7■■■■■ 32.6
TARDBPQ13148 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 32.6
TARDBPQ13148 ACAP3-208ENST00000472541 1946 ntTSL 518.11■□□□□ 0.491e-9■■■■■ 32.6
TARDBPQ13148 ACAP3-211ENST00000479108 485 ntTSL 315.68■□□□□ 0.11e-9■■■■■ 32.6
TARDBPQ13148 ACAP3-203ENST00000354980 582 ntTSL 513.55□□□□□ -0.241e-9■■■■■ 32.6
TARDBPQ13148 ACAP3-205ENST00000438966 265 ntTSL 37.84□□□□□ -1.151e-9■■■■■ 32.6
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TARDBPQ13148 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-10■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-10■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 TMOD1-203ENST00000395211 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 ACACA-236ENST00000615229 1468 ntTSL 1 (best)20.91■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 ACACA-246ENST00000621960 551 ntTSL 59.78□□□□□ -0.842e-8■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 ACACA-228ENST00000613146 3974 ntTSL 1 (best)7.15□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 NUP85-224ENST00000583948 1197 ntTSL 212.13□□□□□ -0.474e-8■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 NUP85-202ENST00000449421 1287 ntTSL 211.68□□□□□ -0.544e-8■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 ARHGAP11B-206ENST00000566548 484 ntTSL 311.59□□□□□ -0.554e-8■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 NUP85-204ENST00000577208 572 ntTSL 47.5□□□□□ -1.214e-8■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 NUP85-221ENST00000583548 562 ntTSL 56.89□□□□□ -1.314e-8■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 STK24-202ENST00000376554 3602 ntTSL 510.34□□□□□ -0.752e-9■■■■■ 32.5
TARDBPQ13148 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.852e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 CLN6-224ENST00000638076 2323 ntTSL 1 (best)20.23■□□□□ 0.832e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.812e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 CLN6-208ENST00000567060 945 ntTSL 216.29■□□□□ 0.22e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 AC107871.1-203ENST00000637054 3238 ntTSL 516.27■□□□□ 0.22e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 AC107871.1-201ENST00000637888 2941 ntTSL 516.18■□□□□ 0.182e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 CLN6-219ENST00000637329 1204 ntTSL 514.15□□□□□ -0.142e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 CLN6-217ENST00000636964 3335 ntTSL 210.72□□□□□ -0.692e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 ENOSF1-207ENST00000579053 1313 ntTSL 513.09□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.183e-10■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-10■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.313e-10■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 AC079062.1-202ENST00000581011 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 AC079062.1-201ENST00000584544 1396 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -12e-7■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.712e-7■■■■■ 32.4
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