Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
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