Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP27A1Q02318 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms