Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA4AP68366 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA4AP68366 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA4AP68366 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA4AP68366 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBA4AP68366 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBA4AP68366 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBA4AP68366 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4AP68366 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms