Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3BP55884 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms