Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAP1L1P55209 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L1P55209 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms