Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFAP3P55082 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFAP3P55082 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms