Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCKSL1P49006 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms