Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX3P48380 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX3P48380 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX3P48380 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX3P48380 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX3P48380 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX3P48380 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX3P48380 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX3P48380 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX3P48380 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX3P48380 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX3P48380 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX3P48380 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX3P48380 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX3P48380 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX3P48380 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX3P48380 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX3P48380 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX3P48380 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX3P48380 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX3P48380 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX3P48380 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX3P48380 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX3P48380 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX3P48380 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX3P48380 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX3P48380 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX3P48380 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX3P48380 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX3P48380 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX3P48380 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX3P48380 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX3P48380 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX3P48380 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX3P48380 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX3P48380 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX3P48380 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX3P48380 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX3P48380 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX3P48380 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX3P48380 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX3P48380 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX3P48380 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX3P48380 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX3P48380 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX3P48380 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX3P48380 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX3P48380 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX3P48380 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX3P48380 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX3P48380 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX3P48380 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX3P48380 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX3P48380 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX3P48380 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX3P48380 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX3P48380 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX3P48380 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX3P48380 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX3P48380 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX3P48380 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX3P48380 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX3P48380 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX3P48380 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX3P48380 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX3P48380 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX3P48380 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX3P48380 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX3P48380 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX3P48380 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX3P48380 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX3P48380 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX3P48380 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX3P48380 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX3P48380 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX3P48380 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX3P48380 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX3P48380 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX3P48380 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX3P48380 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX3P48380 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX3P48380 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX3P48380 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX3P48380 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX3P48380 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX3P48380 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms