Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN1BP46527 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN1BP46527 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms