Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RYKP34925 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RYKP34925 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RYKP34925 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RYKP34925 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RYKP34925 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RYKP34925 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RYKP34925 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RYKP34925 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RYKP34925 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RYKP34925 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RYKP34925 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RYKP34925 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RYKP34925 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RYKP34925 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RYKP34925 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RYKP34925 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RYKP34925 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RYKP34925 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RYKP34925 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RYKP34925 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RYKP34925 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RYKP34925 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RYKP34925 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RYKP34925 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RYKP34925 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RYKP34925 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RYKP34925 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RYKP34925 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RYKP34925 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RYKP34925 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RYKP34925 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RYKP34925 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RYKP34925 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RYKP34925 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RYKP34925 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RYKP34925 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RYKP34925 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RYKP34925 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RYKP34925 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RYKP34925 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RYKP34925 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RYKP34925 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RYKP34925 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RYKP34925 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RYKP34925 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RYKP34925 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RYKP34925 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RYKP34925 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RYKP34925 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RYKP34925 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RYKP34925 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RYKP34925 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RYKP34925 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RYKP34925 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RYKP34925 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RYKP34925 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RYKP34925 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RYKP34925 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RYKP34925 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RYKP34925 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RYKP34925 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RYKP34925 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RYKP34925 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RYKP34925 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RYKP34925 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RYKP34925 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RYKP34925 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RYKP34925 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RYKP34925 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RYKP34925 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RYKP34925 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RYKP34925 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RYKP34925 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RYKP34925 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RYKP34925 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RYKP34925 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RYKP34925 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RYKP34925 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RYKP34925 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RYKP34925 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RYKP34925 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RYKP34925 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms