Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms