Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT3P12035 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT3P12035 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT3P12035 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT3P12035 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT3P12035 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT3P12035 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT3P12035 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT3P12035 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT3P12035 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT3P12035 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT3P12035 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT3P12035 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT3P12035 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT3P12035 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT3P12035 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT3P12035 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT3P12035 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT3P12035 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT3P12035 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT3P12035 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT3P12035 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT3P12035 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT3P12035 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT3P12035 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT3P12035 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT3P12035 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT3P12035 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT3P12035 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT3P12035 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT3P12035 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT3P12035 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT3P12035 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT3P12035 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT3P12035 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT3P12035 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT3P12035 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT3P12035 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT3P12035 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT3P12035 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT3P12035 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT3P12035 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT3P12035 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT3P12035 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT3P12035 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT3P12035 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT3P12035 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT3P12035 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT3P12035 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT3P12035 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT3P12035 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT3P12035 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT3P12035 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT3P12035 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT3P12035 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT3P12035 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT3P12035 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT3P12035 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT3P12035 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT3P12035 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT3P12035 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT3P12035 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT3P12035 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT3P12035 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT3P12035 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT3P12035 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT3P12035 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT3P12035 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT3P12035 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT3P12035 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT3P12035 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT3P12035 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT3P12035 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT3P12035 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT3P12035 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT3P12035 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT3P12035 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT3P12035 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT3P12035 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT3P12035 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT3P12035 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT3P12035 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT3P12035 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT3P12035 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT3P12035 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT3P12035 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT3P12035 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT3P12035 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT3P12035 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT3P12035 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT3P12035 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT3P12035 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT3P12035 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT3P12035 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT3P12035 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT3P12035 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT3P12035 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT3P12035 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT3P12035 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT3P12035 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms