Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN1P07384 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN1P07384 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms